2020-5-5 15:54 |
Исследователи из Кембриджского университета и Германии реконструировали ранние эволюционные пути распространения вируса SARS-CoV-2, который является причиной новой коронавирусной инфекции Covid-19. Они использовали методы генетических сетей, проанализировали первые 160 полных геномов вирусов и нанесли на карту, как, мутируя, вирус распространялся из Уханя в Европу и Северную Америку. «Существует слишком много быстрых мутаций, чтобы аккуратно отследить генеалогическое древо SARS-CoV-2. Мы использовали алгоритм математической сети для одновременной визуализации всех вероятных вариантов», — рассказал руководитель исследования, генетик Питер Фостер из Университета Кембриджа. Он отметил, что эти методы в основном используются для картирования движений доисторических человеческих популяций через ДНК. Пресс-служба университета сообщила, что команда исследователей использовала геномы вирусов со всего мира, полученные с 24 декабря 2019 года по 4 марта 2020 года. Исследование обнаружило три различных «варианта» SARS-CoV-2, которые обозначили как А, B и C. А — «оригинальный геном вируса человека», наиболее близкий тип SARS-CoV-2 к тому, который был обнаружен у летучих мышей. Что удивительно, сообщает Кембриджский университет, изначальный тип вируса не был преобладающим в Ухане. Зато исследователи обнаружили его в слегка мутировавшем виде и в США, и в Австралии. Однако, как подчеркнули в Университете Кембриджа, отдельные американцы сообщали, что живут в Ухане. Правда, не привели конкретных фактов, что тип А в США завезли именно те, кто находился в Ухане во время начала распространения инфекции. Тип А, наиболее близкий к коронавирусу летучих мышей и панголинов, исследователи охарактеризовали как изначальный, благодаря которому и началась в начале вспышка, а потом — пандемия коронавируса. Иллюстрация: cam.ac.uk. В то же время, отметили британские исследователи, по Восточной Азии распространялся другой тип вируса — В. Он не ушел за пределы региона и дальше почти не мутировал. Ученые полагают, что вне региона у людей было «сопротивление» против этого типа коронавируса. Вариант В произошел из типа А после двух мутаций, отметили в Кембридже. А вариант С — производный из В. Он европейский. Его обнаружили у первых пациентов во Франции, Италии, Швеции и Англии. Также его обнаружили в Сингапуре, Гонконге и Южной Корее. Свою работу исследователи из Великобритании и Германии опубликовали на сайте журнала Национальной академии наук (PNAS). В Университете Кембриджа добавили, что программное обеспечение, которое использовалось во время исследований, доступно абсолютно бесплатно. Питер Фостер добавил, что первая инфекция и распространение могли начаться, согласно последних исследований, в период с середины сентября по начало декабря. источник »